Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim71Q1PSW8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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