Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cers3Q1A3B0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms