Protein–RNA interactions for Protein: Q18PI6

Cd84, SLAM family member 5, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd84Q18PI6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd84Q18PI6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd84Q18PI6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd84Q18PI6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd84Q18PI6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd84Q18PI6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd84Q18PI6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd84Q18PI6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd84Q18PI6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd84Q18PI6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd84Q18PI6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd84Q18PI6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd84Q18PI6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd84Q18PI6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd84Q18PI6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd84Q18PI6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd84Q18PI6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd84Q18PI6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd84Q18PI6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd84Q18PI6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd84Q18PI6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd84Q18PI6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cd84Q18PI6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cd84Q18PI6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cd84Q18PI6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cd84Q18PI6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cd84Q18PI6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cd84Q18PI6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cd84Q18PI6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Cd84Q18PI6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Cd84Q18PI6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd84Q18PI6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms