Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptcd3Q14C51 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms