Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

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Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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VgfQ0VGU4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
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VgfQ0VGU4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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VgfQ0VGU4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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VgfQ0VGU4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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VgfQ0VGU4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms