Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Gli2Q0VGT2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli2Q0VGT2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms