Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rundc1Q0VDN7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rundc1Q0VDN7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms