Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kndc1Q0KK55 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Kndc1Q0KK55 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Kndc1Q0KK55 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kndc1Q0KK55 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kndc1Q0KK55 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Kndc1Q0KK55 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kndc1Q0KK55 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kndc1Q0KK55 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kndc1Q0KK55 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kndc1Q0KK55 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kndc1Q0KK55 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms