Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms