Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Sh3bp2Q06649 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms