Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk18Q04899 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms