Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emx2Q04744 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx2Q04744 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms