Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RelaQ04207 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RelaQ04207 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RelaQ04207 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RelaQ04207 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RelaQ04207 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelaQ04207 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelaQ04207 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelaQ04207 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelaQ04207 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelaQ04207 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms