Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms