Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms