Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GscQ02591 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GscQ02591 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GscQ02591 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GscQ02591 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GscQ02591 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GscQ02591 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GscQ02591 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GscQ02591 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GscQ02591 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GscQ02591 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GscQ02591 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GscQ02591 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GscQ02591 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GscQ02591 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GscQ02591 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GscQ02591 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GscQ02591 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GscQ02591 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GscQ02591 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GscQ02591 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GscQ02591 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GscQ02591 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GscQ02591 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GscQ02591 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GscQ02591 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GscQ02591 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GscQ02591 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GscQ02591 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GscQ02591 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GscQ02591 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GscQ02591 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GscQ02591 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GscQ02591 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GscQ02591 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GscQ02591 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GscQ02591 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GscQ02591 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GscQ02591 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GscQ02591 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GscQ02591 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GscQ02591 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GscQ02591 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GscQ02591 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GscQ02591 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GscQ02591 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GscQ02591 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GscQ02591 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GscQ02591 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GscQ02591 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GscQ02591 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GscQ02591 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GscQ02591 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GscQ02591 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GscQ02591 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GscQ02591 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GscQ02591 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GscQ02591 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GscQ02591 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GscQ02591 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GscQ02591 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GscQ02591 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GscQ02591 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GscQ02591 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GscQ02591 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GscQ02591 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GscQ02591 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GscQ02591 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GscQ02591 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GscQ02591 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GscQ02591 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GscQ02591 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GscQ02591 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GscQ02591 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GscQ02591 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GscQ02591 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GscQ02591 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GscQ02591 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GscQ02591 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GscQ02591 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GscQ02591 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GscQ02591 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GscQ02591 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GscQ02591 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GscQ02591 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GscQ02591 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GscQ02591 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GscQ02591 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GscQ02591 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GscQ02591 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GscQ02591 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GscQ02591 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GscQ02591 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GscQ02591 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GscQ02591 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GscQ02591 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GscQ02591 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GscQ02591 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GscQ02591 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GscQ02591 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms