Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms