Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Htr1fQ02284 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms