Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcqQ02111 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms