Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms