Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Top2aQ01320 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms