Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Grin2bQ01097 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Grin2bQ01097 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Grin2bQ01097 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Grin2bQ01097 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Grin2bQ01097 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Grin2bQ01097 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Grin2bQ01097 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Grin2bQ01097 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Grin2bQ01097 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Grin2bQ01097 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Grin2bQ01097 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Grin2bQ01097 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Grin2bQ01097 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Grin2bQ01097 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Grin2bQ01097 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Grin2bQ01097 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Grin2bQ01097 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Grin2bQ01097 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Grin2bQ01097 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Grin2bQ01097 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Grin2bQ01097 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Grin2bQ01097 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Grin2bQ01097 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Grin2bQ01097 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Grin2bQ01097 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Grin2bQ01097 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Grin2bQ01097 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Grin2bQ01097 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Grin2bQ01097 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Grin2bQ01097 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Grin2bQ01097 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Grin2bQ01097 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Grin2bQ01097 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms