Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms