Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms