Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca2P97929 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca2P97929 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca2P97929 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca2P97929 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca2P97929 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca2P97929 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brca2P97929 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brca2P97929 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms