Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AlkP97793 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AlkP97793 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
AlkP97793 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
AlkP97793 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
AlkP97793 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AlkP97793 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AlkP97793 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AlkP97793 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AlkP97793 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AlkP97793 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AlkP97793 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AlkP97793 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AlkP97793 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AlkP97793 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AlkP97793 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AlkP97793 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AlkP97793 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AlkP97793 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AlkP97793 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AlkP97793 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AlkP97793 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AlkP97793 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AlkP97793 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AlkP97793 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AlkP97793 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AlkP97793 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AlkP97793 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AlkP97793 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AlkP97793 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AlkP97793 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AlkP97793 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AlkP97793 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AlkP97793 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AlkP97793 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AlkP97793 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AlkP97793 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AlkP97793 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AlkP97793 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AlkP97793 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AlkP97793 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AlkP97793 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AlkP97793 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AlkP97793 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AlkP97793 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AlkP97793 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AlkP97793 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AlkP97793 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AlkP97793 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AlkP97793 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AlkP97793 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AlkP97793 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AlkP97793 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AlkP97793 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AlkP97793 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AlkP97793 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AlkP97793 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AlkP97793 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AlkP97793 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AlkP97793 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AlkP97793 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AlkP97793 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AlkP97793 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AlkP97793 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AlkP97793 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AlkP97793 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AlkP97793 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AlkP97793 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AlkP97793 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AlkP97793 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AlkP97793 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AlkP97793 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AlkP97793 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AlkP97793 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AlkP97793 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AlkP97793 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AlkP97793 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AlkP97793 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AlkP97793 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AlkP97793 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AlkP97793 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AlkP97793 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AlkP97793 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AlkP97793 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AlkP97793 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AlkP97793 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AlkP97793 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AlkP97793 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AlkP97793 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AlkP97793 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AlkP97793 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AlkP97793 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AlkP97793 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AlkP97793 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AlkP97793 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AlkP97793 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AlkP97793 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AlkP97793 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AlkP97793 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms