Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cry1P97784 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cry1P97784 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cry1P97784 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cry1P97784 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cry1P97784 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cry1P97784 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cry1P97784 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cry1P97784 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms