Protein–RNA interactions for Protein: P97477

Aurka, Aurora kinase A, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkaP97477 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkaP97477 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkaP97477 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkaP97477 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkaP97477 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkaP97477 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AurkaP97477 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms