Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smyd1P97443 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms