Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms