Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms