Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Chl1P70232 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chl1P70232 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chl1P70232 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chl1P70232 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chl1P70232 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chl1P70232 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chl1P70232 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chl1P70232 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chl1P70232 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chl1P70232 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chl1P70232 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chl1P70232 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chl1P70232 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Chl1P70232 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chl1P70232 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chl1P70232 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms