Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf6P70196 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf6P70196 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf6P70196 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf6P70196 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf6P70196 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf6P70196 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf6P70196 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf6P70196 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf6P70196 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf6P70196 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf6P70196 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms