Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl18aP62717 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms