Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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