Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Vbp1P61759 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Vbp1P61759 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Vbp1P61759 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Vbp1P61759 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Vbp1P61759 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Vbp1P61759 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Vbp1P61759 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Vbp1P61759 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Vbp1P61759 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Vbp1P61759 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Vbp1P61759 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Vbp1P61759 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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