Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx1bP61264 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms