Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms