Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhbdl3P58873 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhbdl3P58873 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhbdl3P58873 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhbdl3P58873 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhbdl3P58873 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhbdl3P58873 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhbdl3P58873 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhbdl3P58873 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhbdl3P58873 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhbdl3P58873 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhbdl3P58873 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhbdl3P58873 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhbdl3P58873 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhbdl3P58873 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhbdl3P58873 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhbdl3P58873 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhbdl3P58873 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhbdl3P58873 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhbdl3P58873 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhbdl3P58873 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhbdl3P58873 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rhbdl3P58873 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rhbdl3P58873 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Rhbdl3P58873 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms