Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms