Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms