Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace1P56818 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace1P56818 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace1P56818 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace1P56818 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace1P56818 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace1P56818 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace1P56818 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace1P56818 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace1P56818 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace1P56818 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace1P56818 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace1P56818 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Bace1P56818 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms