Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gp1bbP56400 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms