Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtskP55097 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtskP55097 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtskP55097 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtskP55097 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtskP55097 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtskP55097 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtskP55097 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtskP55097 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtskP55097 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtskP55097 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtskP55097 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtskP55097 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtskP55097 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtskP55097 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CtskP55097 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtskP55097 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtskP55097 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtskP55097 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtskP55097 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtskP55097 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtskP55097 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtskP55097 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtskP55097 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtskP55097 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtskP55097 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtskP55097 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtskP55097 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtskP55097 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtskP55097 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtskP55097 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtskP55097 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CtskP55097 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CtskP55097 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtskP55097 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CtskP55097 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtskP55097 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtskP55097 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtskP55097 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtskP55097 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CtskP55097 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtskP55097 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtskP55097 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtskP55097 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtskP55097 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtskP55097 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtskP55097 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtskP55097 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtskP55097 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtskP55097 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtskP55097 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtskP55097 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtskP55097 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtskP55097 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtskP55097 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtskP55097 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtskP55097 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtskP55097 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtskP55097 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtskP55097 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtskP55097 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtskP55097 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtskP55097 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CtskP55097 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtskP55097 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CtskP55097 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CtskP55097 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtskP55097 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtskP55097 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtskP55097 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtskP55097 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtskP55097 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtskP55097 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtskP55097 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtskP55097 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtskP55097 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtskP55097 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtskP55097 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtskP55097 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtskP55097 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtskP55097 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtskP55097 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtskP55097 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtskP55097 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtskP55097 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtskP55097 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtskP55097 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtskP55097 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CtskP55097 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtskP55097 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtskP55097 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtskP55097 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtskP55097 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtskP55097 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CtskP55097 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtskP55097 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CtskP55097 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtskP55097 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtskP55097 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtskP55097 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms