Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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RabggtbP53612 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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RabggtbP53612 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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