Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cux1P53564 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cux1P53564 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cux1P53564 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cux1P53564 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cux1P53564 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cux1P53564 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cux1P53564 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cux1P53564 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cux1P53564 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms