Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp1P52624 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp1P52624 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp1P52624 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp1P52624 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp1P52624 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp1P52624 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp1P52624 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Upp1P52624 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp1P52624 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp1P52624 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp1P52624 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms