Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms