Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApodP51910 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApodP51910 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApodP51910 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApodP51910 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApodP51910 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApodP51910 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApodP51910 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApodP51910 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApodP51910 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApodP51910 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApodP51910 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApodP51910 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ApodP51910 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApodP51910 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApodP51910 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApodP51910 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApodP51910 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ApodP51910 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ApodP51910 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApodP51910 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ApodP51910 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApodP51910 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApodP51910 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApodP51910 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApodP51910 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApodP51910 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApodP51910 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApodP51910 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApodP51910 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApodP51910 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApodP51910 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApodP51910 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApodP51910 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApodP51910 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApodP51910 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApodP51910 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApodP51910 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ApodP51910 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ApodP51910 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ApodP51910 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ApodP51910 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApodP51910 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApodP51910 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApodP51910 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApodP51910 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ApodP51910 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApodP51910 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApodP51910 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ApodP51910 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApodP51910 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApodP51910 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApodP51910 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ApodP51910 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApodP51910 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApodP51910 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApodP51910 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApodP51910 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApodP51910 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApodP51910 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApodP51910 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApodP51910 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApodP51910 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApodP51910 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ApodP51910 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApodP51910 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ApodP51910 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApodP51910 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ApodP51910 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApodP51910 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApodP51910 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApodP51910 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApodP51910 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApodP51910 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApodP51910 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApodP51910 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApodP51910 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApodP51910 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApodP51910 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApodP51910 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApodP51910 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApodP51910 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApodP51910 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApodP51910 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ApodP51910 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApodP51910 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApodP51910 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApodP51910 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApodP51910 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApodP51910 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApodP51910 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApodP51910 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ApodP51910 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApodP51910 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ApodP51910 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApodP51910 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ApodP51910 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApodP51910 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApodP51910 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApodP51910 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms