Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms